Kokoomuksella on monien muiden valtakunnallisten järjestöjen tapaan kolmiportainen organisaatio.
- Jäsen kuuluu paikallisyhdistykseen
- Paikallisyhdistys kuuluu puolueeseen (kunta)
- Kunnallisjärjestö yhdistää suurempien kuntien paikallisyhdistyksiä (kunta)
- Piirijärjestö yhdistää kunkin vaalipirin yhdistyksiä (vaalipiiri)
- Valtakunnan tasolla toimii puolue ja sen kolme jäsenliittoa (valtakunta)
Jäsenet kuuluvat siis pääsääntöisesti paikallisiin yhdistyksiin. Yhdistykset puolestaan kuuluvat kuntakohtaisiin kunnallisjärjestöihin, vaalipiirikohtaisiin piirijärjestöihin ja puolueeseen. Osa paikallisyhdistyksistä kuuluu lisäksi jäsenliittoihin ja niiden piirijärjestöihin.
Lähes kaikkien paikallisyhdistysten toimialue on joku Suomessa oleva kunta. Lähes jokaisessa Manner-Suomen kunnassa on kokoomuksen paikallisyhdistys, isommissa useampikin ja suurimmissa suurimmissa useita kymmeniä.
Lisäksi toiminnassa on neljä Suomen ulkopuolella toimivaa yhdistystä (Aurinkorannikko, Westminster, Bryssel ja Kanaria) sekä Kokoomuksen valtakunnallinen henkilöjäsenyhdistys.
Osassa puolueen ja jäsenliittojen piirijärjestöjä on mahdollista myös kuulua henkilöjäsenenä piirijärjestöön. Myös opiskelijaliitto Tuhatkunnassa voi olla henkilöjäseniä.
Lisäksi ”Kokoomuskonserniin” kuuluu iso joukko toimijoita, jotka eivät ole Kansallinen Kokoomus rp:n jäseniä. Näitä kutsutaan puolueen läheisjärjestöiksi.
